根據中華人民共和國所得稅法實施條例第四十一條文件相關規定，企業撥繳的工會經費，不超越薪酬、薪水總額2%的部分，準予扣除。
根據 (國稅函〔2009〕3號)第二條之規定：“關于薪酬薪水總額問題 《實施條例》第四十、四十一、四十二條所稱的‘薪酬薪水總額’，是指企業按照本通知第一條規定實踐發放的薪酬薪水總和，不包括企業的費、教育經費、工會經費以及養老保險費、醫療保險費、賦閑保險費、工傷保險費、生育保險費等社會保險費和住房公積金。屬于國有性質的企業，其薪酬薪水，不得超越政府有關部門給予的限定數額;超越部分，不得計入企業薪酬薪水總額，也不得在核算企業應納稅所得額時扣除。”
因此，工會經費的基數是企業實踐發放的薪酬薪水總和。值得注意的是，這里所說的“實踐發放數”并不是“實發數”。“實發數”一般是指扣除了各項費用后，實踐發放到員工手中的薪酬金額，扣除的各項費用或許包括個人所得稅、個人應承擔的社保費用，乃至有些單位還會直接從薪酬中扣黨費、會費、書報費等等。
明顯，答應在企業所得稅稅前扣除的工會經費扣除基數，應該是指應由企業實踐承擔的支交給個人的薪酬薪水費用，即扣除個人所得稅以及個人交納的社保公積金等費用之前的應發數，等同于“應付薪酬”概念。
