引起媒體熱議的是《通知》第二條的內容，即為提供的交通、住宅、通信待遇，現已實施貨幣化變革的，按月按標準發放或付出的住宅補助、交通補助或者車改補助、通信補助，應當歸入員工工資總額，不再歸入費辦理;沒有實施貨幣化變革的，企業產生的相關開銷作為員工費辦理，但根據國家有關企業住宅制度變革政策的一致規定，不得再為員工購建住宅。企業給員工發放的節日補助、未一致供餐而按月發放的午餐費補助，應當歸入工資總額辦理。
首都經貿大學教授、我國注冊稅務師協會常務理事丁蕓說：“《通知》并沒有改動現行的稅收政策，僅僅清晰了員工福利費的界說及其規模，對員工福利費的財務辦理作了進一步規定。無論是企業所得稅仍是個人所得稅，現行的稅收政策并未改動。”
北京金華融稅務師事務所董事長王培在剖析《通知》的出臺布景時指出，財政部2006年公布修訂后的《企業財務通則》，已將本來應當由員工福利費開支的根本醫療保險、彌補醫療保險、彌補養老保險等內容，直接列入成本(費用)。財政部《關于實施修訂后的〈企業財務通則〉有關問題的通知》(財企[2007]48號)中清晰，修訂后的《企業財務通則》實施后，企業不再依照工資總額的14%計提員工福利費，終結了現已連續了幾十年的員工福利費財務制度。
